本课题组利用数理统计学、几何拓扑学、数学建模等技术手段，研发生物信息学新算法，应用于细胞生物学和发育生物学研究中。近年来的科研工作中，通过结合单细胞测序技术与空间转录组技术，建立数学模型，整合多组学信息，绘制单细胞精度的时空转录组图谱，在时间和空间四维层面上研究早期胚胎发育及相关疾病的调控网络和分子机制。作为第一或共同第一作者，研究成果发表于Nature Communications, Cell Research, Genomics Proteomics & Bioinformatics, Cell Reports, Stem Cell Reports, Journal of Molecular Cell Biology, Journal of Biological Chemistry等国际学术期刊；在Nature, Nature Cell Biology, Developmental Cell等发表共同作者论文十余篇。