基因功能预测注释
基因是遗传的基本功能单位,对基因功能的鉴定是生命科学研究的基础。但很大部分基因的功能仍不清楚,多数研究精力和资源都集中在如TP53等少数基因上,这严重影响和阻碍了生命医学科学研究的进展。实验室前期建立了系统生物学分析方法GeneBridge(https://www.systems-genetics.org/genebridge),利用转录组学大数据来对基因功能进行预测和注释,并将该方法应用到1700多个转录组大数据集。GeneBridge的主要优势是预测准确率高,并可以预测基因与通路的负相关和组织特异性功能,以及分子通路之间的关联。利用该方法,我们预测了上百万个基因与通路的关联,其中很大部分基因-通路的关联是之前研究中未被发现的。这一概念验证性(Proof of concept)研究证明了利用生物大数据来预测基因功能以及分子通路之间关联的可行性。
实验室将进一步开发和改进系统遗传学分析方法,通过对组学大数据的挖掘和整合分析来进行基因功能预测和注释,为疾病发病机制的研究奠定基础。

https://www.systems-genetics.org/genebridge




