2018-2023
 模态碎片化知识挖掘、融合与应用（国家自然科学基金创新研究群体项目，研究骨干）

2017/01-2021/12
大数据的统计学基础与分析方法（国家自然科学基金重大项目，主持人）

2017

大数据分析与处理的数学基础与核心算法研究－西安国际数学与数学技术研究中心的培育与建设（国家自然科学基金，主持人）

2016
西安数学与数学技术研究中心的培育与建设（国家自然科学基金，主持人） 

2015
数学主导的信息技术研究中心的培育与建设（国家基础科学人才培养基金专项基金项目，主持人）

2014-2017

致密油气藏地震资料反演的混合建模与基础算法（国家自然科学基金重大研究计划，主持人）

2013-2017

非结构化环境下的智能感知基础理论与关键技术（国家重点基础研究计划（973），首席科学家）

2013-2016

西安交通大学数学基地科研训练与科研能力提高项目（国家基础科学人才培养基金, 主持人)

2012-2016
稀疏信息处理的数学理论与方法（国家自然科学基金重点项目）

2011-2013
L（1/2）正则化理论及在稀疏微波成像中的应用 （国家自然科学基金项目，主持人）

2009-2013
 可信软件基础重大研究计划管理经费（国家自然科学基金， 主持人）

2007-2011
基于视觉认知的非结构化信息处理理论与关键技术（973项目，首席科学家）

2006-2009
高复杂性数据挖掘的理论、算法及其在管理学中的应用（国家自然科学基金重点项目，主持人)

2006-2008 
关于支撑向量回归机的模型选择问题（国家自然科学基金，主持人）

2004-2007
关于神经网络不同模型化方法的比较研究及其统一理论（国家自然科学基金，主持人）

2003-2006
智能信息处理技术与信息科学计算方法（西安交通大学“十五”“211工程”建设项目，主持人）

2003-2005

预测和控制突发恶性传染病的动力学机理与数学方法（国家基金委天元基金重大项目，联合主持人）

2001-2004 
数据挖掘的核心算法与应用软件平台（国家863基金，主持人）

2000-2003 
信息与计算科学的数学理论与方法（国家教育部“振兴教育行动计划”重点项目，主持人） 

2000-2002: 
模拟演化计算技术的效率加速理论及其实现（国家自然科学基金，主持人)

1998-2000
快速自适应模拟演化计算技术及其理论基础（国家863基金，主持人）

1997-1999
模拟大脑决策模型―可变规划（香港UGC基金，中方负责人）

1996-1998

关于演化计算技术的核心基础研究（国家863基金，主持人)

1995-1998

关于解全局优化问题仿生类算法的基础研究（国家自然科学基金，主持人)

1995-1998
 解多元多目的地通讯问题的神经网络方法（香港UPGC基金，中方负责人） 

1994-1996
用于时空推理的混合专家系统―专家系统与神经网络技术的融合（香港UPGC基金，中方负责人） 

1992-1995
 关于人工神经网络全局极值问题的算法研究（国家教委留学回国人员基金，主持人) 

1992-1994
  求非线性方程组全部解的动力系统胞腔分析方法（国家教委博士点基金，主持人）

1990-1992
关于解大规模非线性方程组扩展的区间数学方法（国家自然科学基金，主持人）