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郑芳
教授，博士研究生导师
学历：博士研究生
学位： 生物工程理学博士
最高学位授院校：比利时布鲁塞尔自由大学
所学专业：细胞与分子免疫学
参加工作时间：2009年
来校工作时间： 2014年
细胞与生物化学党支部书记
技术职位：教授，博士研究生导师
单位：西安交通大学 医学部 基础医学院 生物化学与分子生物学系
Zheng Fang
ProfessorPromotor of postgraduate
Degree: Ph.D.
Doctor of Science degree: biologicalscience engineering
Highest degree granted institutions: Free University of Brussels, Belgium
Major: Cellular and molecular immunology
Department: Xi 'an Jiaotong University, School of Medicine, Basic Medicine, Department of Biochemistry and Molecular Biology
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地址：陕西省西安市雁塔西路76号
Email：fang.zheng@xjtu.edu.cn
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研究方向：纳米抗体与蛋白质工程
师从纳米抗体创始人Serge Muyldermans教授，以纳米抗体、结构生物学和分子影像学为核心技术手段，基于实验性炎症与肿瘤动物模型平台，利用荧光和核素技术对免疫细胞及肿瘤细胞进行示踪和靶向治疗。博士后期间，在加拿大光遗传学领域权威Robert Campbell教授课题组从事荧光探针开发及光遗传学研究，进一步拓展了研究领域。
主持和参与了多项高水平科研项目，包括重点研发青年科学家项目骨干，国家外国专家项目，国家自然科学基金，教育部留学基金，教育部重点实验室青年骨干项目，陕西省自然科学基金重点研发和面上项目，西安交通大学“启航海外学者合作项目”等。
在国际顶级期刊上发表了30余篇高水平研究论文，包括Nucleic Acids Research（影响因子19.1）、Journal of Nuclear Medicine（影响因子11.8）和Nature Communications（影响因子17.6，获F1000推荐，ESI全球前1%高被引）。其中，单篇最高被引470次。获批1项单域重链抗体相关欧洲专利，以及6项中国发明专利，另有3项中国发明专利正在申请中。
担任省级一流课程《生物化学》的负责人，主编全国高等教育双语教材《医学分子生物学》（人民卫生出版社）以及西安交通大学本科重点教材《生物科技论文写作》。主持或参与教改课题15项，其中国家级教改课题7项，并发表教改论文6篇。荣获“101计划”全国基础医学青年授课比赛三等奖、西安交通大学“优秀班主任”称号、陕西省青年教师比赛三等奖及“全国来华留学生本科教育青年教师英语授课教学能手”等多项荣誉，并担任“侯宋濂基础医学拔尖班2.0”工作组核心成员。
是多个国内外学术组织的活跃成员，包括世界分子影像学会（WMIS）、欧洲分子影像学会（ESMI）、中国生物化学与分子生物学学会、中国医药教育协会（常务委员）、中国微米纳米技术学会及陕西省医学会等。她与比利时布鲁塞尔自由大学、美国西北大学、加拿大阿尔伯塔大学、日本东京大学及三亚崖州湾科技城建立了长期稳定的合作关系。
Research Interests:
Dr. Zheng has been extensively involved in cutting-edge research on nanobodies during her Ph.D. at Vrije Universiteit Brussel and Vlaams Instituut voor Biotechnologie (Belgium), recognizing the immense potential of these smallest antibody fragments in preclinical and clinical applications. Her previous work focused on in vivo monitoring of arthritic and hepatitis mouse models using nanobody-based molecular imaging probes targeting complement receptors via SPECT/CT.
Currently, her research delves into cancer immunology, with a particular emphasis on in vivo imaging of tumor-associated macrophages and the development of nanobodies targeting immune checkpoint molecules for applications in cancer immunotherapy. Beyond cancer immunology, Dr. Zheng has contributed to collaborative projects on the structural and functional studies of nanobody recognition mechanisms at the molecular level, as well as research on microbiology and microbial resistance mechanisms.
More recently, in collaboration with Dr. Robert Campbell at the University of Alberta, Canada, she has expanded her research portfolio to include the development of genetically encoded fluorescent biosensors using nanobodies. Dr. Zheng's work has been published in high-impact journals such as Nature Communications, Nucleic Acids Research, Scientific Reports, and Journal of Nuclear Medicine, reflecting her significant contributions to nanobody-based molecular imaging and therapeutic research.
人才项目:
1. 获得2018年医学部第二批国家级人才后备人选支持计划-攀登人才计划
2. 获得陕西省高校科协青年人才托举计划
3.陕西省生物化学与分子生物学学会第一届教学委员会委员
4. 中国医学教育协会中医药教育促进会常务委员
个人获奖:
16. 2024年度西安交通大学基础医学院“人才培养先进工作者”称号和“公共服务奖”。
15.2024年西安交通大学第九届教学优秀团队奖“生物化学与分子生物学教学团队”（团队 8/15）
14.2024年 西安交通大学第十八届教学成果奖“以提升能力为目标的三融三式医学生物基础课程教学模式的构建与实践”（参与人 8/10）
13.2024年 西安交通大学第十八届教学成果奖“基础医学院人才培养模式探索与实践”（参与人 8/15）
12.2024年全国基础医学青年教师授课比赛 三等奖
11.2024年“十校联盟”科研教学交流 优秀奖
10.2023年全国来华留学生本科教育青年英语授课 教学能手（二等奖）
9.2023年秦创原 陕西省科技工作者创新创业大赛 三等奖
8.2023年西安交通大学 优秀班主任
7.2023年陕西省青年教师教学大赛，三等奖
6.2022年陕西省科技工作者创新创业大赛 三等奖
5.2022年第三届全国健康长寿奖，三等奖
4.2021年第二届全国健康长寿奖，银奖，项目获得创业资助立项
3.“单域重链抗体在精准生物诊疗一体化中的应用”陕西省科技工作者创新创业大赛，2017，铜奖
2. The 5th Hsien Wu and Ray Wu Symposia，2017，青年论坛奖
1. 2016年全国生物化学与分子生物学年会，2016，最佳壁报奖
指导学生获奖：
8.“智汇滨海·领航未来”2025年滨城人才创新创业大赛 （谢宇）
7.西安交通大学关键“卡脖子”技术交流会常熟专场（谢宇）
6.2024年西安交通大学基础医学年会 墙报 一等奖（何小雨），优秀奖（张嘉欣），本科优秀奖 （陈宇轩、刘煜安、闫锦、谢宇、赵文伦、张云淏）
5.首届教育部基础医学“101计划”拔尖学生创新论坛 （闫锦、谢宇、于洋、刘昱安） 三等奖
4. 西安交通大学“腾飞杯”创业竞赛 2022年，三等奖（指导老师）
3. 莫缓椰，刘彤，张妮，Precise 单域抗体影像学，2018微软“创新杯”陕西高校大学生创新创业大赛，优秀奖 （指导老师）
2. 莫缓椰，刘彤，张妮，李子乾，杜宇芩，费宇，单域重链抗体在肿瘤精准诊断中的应用，2018年 西安交通大学大学生创新创业项目，三等奖（指导老师）
1. 莫缓椰，刘彤，张妮，李子乾，杜宇芩，费宇，西安交通大学第十二届“腾飞杯”创业竞赛，三等奖（指导老师）
专利及科研转化：
- 授权欧洲专利1项，中国发明专利6项，申请中国发明专利1项，申请国际PCT发明专利1项
- 申请中国发明专利2项 （仪器）
- “一种Vsig4纳米抗体及其抗原表位鉴定方法和应用”和“一种Clec4F纳米抗体的应用”，两个专利实现专利转化。
- 获得陕西省秦创原春种种子基金100万元资助。
- 参与2022年参与“纳米抗体技术”成果转化框架协议（横向项目）
- 主持2025年“基于荧光探针技术研发的污染物检测设备”成果转化协议。
Publications：
(30)Wenbo He† , Zhenlin Ouyang† , Jiaxin Zhang, Xiaolong Guo, Min Jiao, Qian Qin, Xiaoyu He, Li Kang, Peter M. Hwang, Fang Zheng, Guangjian Zhang *, Yurong Wen *. Structural and mechanistic insights into the transcriptional regulation of chromosomal T6SS by large conjugative plasmid-encoded TetRs in Acinetobacter baumannii.Nucleic Acids Research, 2025, 53, gkaf755
(29)Zhenlin Ouyang #, Wenbo He #, Di Wu, Hao An, Lei Duan, Min Jiao, Xiaoyu He, Qinyue Yu, Jiaxin Zhang, Qian Qin, Ruochen Wang, Fang Zheng, Peter M Hwang, Xiaoting Hua, Li Zhu*, Yurong Wen*. (2025) Cryo-EM structure and complementary drug efflux activity othe Acinetobacter baumannii multidrug efflux pump AdeG. Structure. 2025, 33: 1-13. (IF:4.5, Cell 子刊)
(28)Min Jiao, Wenbo He, Zhenlin Ouyang, Qinyue Yu, Jiaxin Zhang, Qian Qin, Ruochen Wang, Xiaolong Guo, Ruihan Liu, Xiaoyu He, Peter M. Hwang, Fang Zheng, Yurong Wen*. (2025) Molybdate uptake interplay with ROS tolerance modulates bacterial pathogenesis. Science Advances. 11(3):eadq9686 (IF:11.7,Science 子刊)
(27)Jinhong Zhou#，Moath Refat#，Yucheng Guo， Jiaxin Zhang，Min Jiao，Wenbo He，Xiaoyu He，Mai A. Rabie，Zhenlin Ouyang*，Fang Zheng*. The Functional Study of Response Regulator ArlR Mutants in Staphylococcus Aureus. Applied Biochemistry and Biotechnology. 2024. https://doi.org/10.1007/s12010-024-04919-1
(26)Zhenlin Ouyang*, Wenbo He, Min Jiao, Qinyue Yu, Yucheng Guo, Moath Refat, Qian Qin, Jiaxin Zhang, Qindong Shi, Fang Zheng and Yurong Wen*.Mechanistic and biophysical characterization of polymyxin resistance response regulator PmrA in Acinetobacter baumannii. Front Immunol..2024. 15:1293990. doi: 10.3389/fmicb.2024.1293990
(25) Ting Yu#, Fang Zheng#, Wenbo He, Serge Muyldermans, Yurong Wen*. Single Domain Antibody: Development and Application in Biotechnology and Biopharma. Immunological Reviews.2024. DOI: 10.1111/imr.13381. (IF: 10.7, 并列第一)
(24) Wenbo He #, Ke Wu #, Zhenlin Ouyang, Yixin Bai, Wen Luo, Di Wu, Hao An, Yucheng Guo, Min Jiao, Qian Qin, Jiaxin Zhang, Yi Wu, Junjun She, Peter M. Hwang, Fang Zheng, Li Zhu*, Yurong Wen*. Structure and Assembly of Type VI secretion system cargo delivery vehicle. Cell Reports. 2023. 42. 112781. (Cell 子刊, IF: 9.995)
(23) Fang Zheng*, Geert Raes, Shemin Lu and Qian Chen. Editorial: Immunometabolism in autoimmune and autoinflammatory disorders. Front Immunol..2024. 14:1285720.doi: 10.3389/fimmu.2023.1285720
(22) Min Jiao, Wenbo He, Zhenlin Ouyang, Qian Qin, Yucheng Guo, Jiaxin Zhang, Yixin Bai, Xiaolong Guo, Qinyue Yu, Junjun She, Peter M. Hwang, Fang Zheng, Yurong Wen*. Mechanistic and Structural insights into the bifunctional enzyme PaaY from Acinetobacter baumannii. Structure. 2023.31. 935-947. (Cell 子刊)
(21) Yucheng Guo, Zhenlin Ouyang, Wenbo He, Jiaxin Zhang, Qian Qin, Min Jiao, Serge Muyldermans, Fang Zheng*, Yurong Wen*. Screening and epitope characterization of diagnostic nanobody against total and activated Bacteroides fragilis toxin. Front Immunol. 2023 Feb 10;14:1065274. doi: 10.3389/fimmu.2023.1065274.
(20) Qin Q, Liu H, He W, Guo Y, Zhang J, She J, Zheng F, Zhang S, Muyldermans S, Wen Y*. Single Domain Antibody application in bacterial infection diagnosis and neutralization.Front Immunol. 2022 Sep 29;13:1014377. doi: 10.3389/fimmu.2022.1014377. PMID: 36248787
(19) Zheng F; Pang, Y; Li L; Pang Y; Zhang J; Wang X; Raes G. Frontiers in Immunology. 2022，13：978513.（ IF: 8.7，第一作者，综述）
(18) Zhenlin Ouyang#, Fang Zheng#, Li Zhu#, Jan Felix, Di Wu, Ke Wu, Irina Gutsche, Yi Wu, Peter M Hwang, Junjun She*, Yurong Wen*. Proteolysis and multimerization regulate signaling along the two-component regulatory system AdeRS. iScience. 2021,24(5): 102476. DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2021.102476 (Cell子刊, IF: 5.35, 并列第一作者) PMID: 34113820
(17) Fang Zheng, Jinhong Zhou, Zhenlin Ouyang, Jiaxin Zhang, Xinyi Wang, Serge Muyldermans, Jo Van Ginderachter, Nick Devoogdt, Yurong Wen*, Steve Schoonooghe* and Geert Raes*.Development and characterization of nanobodies targeting the Kupffer cell. Frontiers in Immunology, 2021, 12 : 641819. DOI10.3389/fimmu.2021.641819(IF:7.56, 第一作者 ) PMID: 33692811
(16) Zhenlin Ouyang#, Fang Zheng#, Yingmei Pei, Jinhong Zhou, Keqing Wen, Miao Han, Peter M. Hwang, M. Joanne Lemieux, Yurong Wen*. (2019) Deciphering the activation and recognition mechanisms of Staphylococcus aureus response regulator ArlR. Nucleic Acids Research. 2019, 47(21):11418-11429.（IF: 16.97,并列第一作者）DOI10.1093/nar/gkz891 PMID: 31598698
(15) Fang Zheng, Siyu Luo , Zhenlin Ouyang, Jinhong Zhou, Huanye Mo, Steve Schoonoogh, Serge Muyldermans , Patrick De Baetselier, Geert Raes *,and Yurong Wen*. NIRF-Molecular Imaging with Synovial Macrophages-Targeting Vsig4 Nanobody for Disease Monitoring in a Mouse Model of Arthritis. International Journal of Molecular sciences. July 2019.20（13） （IF: 5.923, 第一作者）PMID: 31288389 PMCID: PMC6651725 DOI: 10.3390/ijms20133347
(14) Zhenlin Ouyang, Jan Felix, Jinhong Zhou, Yingmei Pei, Bohan Ma, Peter M. Hwang M. Joanne Lemieux, Irina Gutsche, Fang Zheng# Yurong Wen#. Trimeric structure of the mouse Kupffer cell C‐type lectin receptor Clec4f. FEBS letters, Augest 2019.541（1）：189-198 （SCI IF：4.12 通讯作者）DOI10.1002/1873-3468.13565 PMID: 31369681
(13) Yurong Wen#*, Zhenlin Ouyang#, Yue Yu, Xiaorong Zhou, Yingmei Pei, Bart Devreese, Paul G. Higgins, Fang Zheng*. Mechanistic insight into how multidrug resistant Acinetobacter baumannii response regulator AdeR recognizes an intercistronic region. Nucleic Acids Research. SEP 2017,45（16）：9773-9787）（SCI IF：16.97 通讯作者）PMID: 28934482 PMCID: PMC5766154 DOI: 10.1093/nar/gkx624
(12) Wen Y#*, Ouyang Z#, Devreese B, He W, Shao Y, Lu W, Zheng F*.Crystal structure of master biofilm regulator CsgD regulatory domain reveals an atypical receiver domain. Protein Sci. 2017 Jul 30. 26(10)：2073-2082 （通讯作者 SCI IF：6.72）PMID: 28758290 PMCID: PMC5606546 DOI: 10.1002/pro.3245
(11) Yurong Wen#, Zhenlin Ouyang#, Steve Schoonooghe, Siyu Luo, Patrick De Baetselier, Wuyuan Lu, Serge Muyldermans, Geert Raes, Fang Zheng*. (2017). Structural evaluation of a nanobody targeting complement receptor Vsig4 and its cross reactivity. Immunobiology. 222(6): 807-813. (IF: 3.14, 通讯作者) PMID: 27889311 DOI: 10.1016/j.imbio.2016.11.008
(10) Zheng Fang#, Sparkes Amanda#, De Baetselier Patrick, Schoonooghe, Steve, Stijlemans Benoit, Muyldermans, Serge, Flamand Veronique, Van Ginderachter Jo A, Devoogdt Nick, Raes Geert, Beschin Alain*. Molecular Imaging with Kupffer Cell-Targeting Nanobodies for Diagnosis and Prognosis in Mouse Models of Liver Pathogenesis. MOLECULAR IMAGING AND BIOLOGY. Feb 2017, 19 (1):49-58.((IF: 3.48, 第一作者) )PMID: 27339464 DOI: 10.1007/s11307-016-0976-3
(9) Zheng F, Perlman H, Matthys P, Wen Y, Lahoutte T, Muyldermans S, Lu S, De Baetselier P, Schoonooghe S, Devoogdt N, Raes G. Specificity Evaluation and Disease Monitoring in Arthritis Imaging with Complement Receptor of the Ig superfamily targeting Nanobodies. Scientific Reports. 2016 Oct 25;6:35966. doi: 10.1038/srep35966. （SCI IF：5.2）
(8) Charlotte L. Scott, Fang Zheng, Patrick De Baetselier, Liesbet Martens, Yvan Saeys, Sofie De Prijck, Saskia Lippens, Chloé Abels, Steve Schoonooghe, Geert Raes, Nick Devoogdt, Bart N. Lambrecht, Alain Beschin* and Martin Guilliams*. Bone marrow derived monocytes give rise to self-renewing and fully differentiated Kupffer cells. Nature communications. 2016 Jan. （SCI IF：12.5，Nature子刊，SCI 高被引论文, 被引346）
(7) Fang Zheng#, Amanda Sparkes#, Patrick De Baetselier, Steve Schoonooghe, Benoit Stijlemans, Serge Muyldermans,Véronique Flamand, Jo A Van Ginderachter, Nick Devoogdt, Geert Raes, Alain Beschin. Molecular Imaging with Kupffer Cell-Targeting Nanobodies for Diagnosis and Prognosis in Mouse Models of Liver Pathogenesis. Mol Imaging Biol (2016). DOI: 10.1007/s11307-016-0976-3 （SCI IF：3.1）
(6) Yurong Wen#, Zhenlin Ouyang#, Steve Schoonooghe, Siyu Luo4, Patrick De Baetselier, Wuyuan Lu, Serge Muyldermans, Geert Raes*, Fang Zheng*. Structural evaluation of a Nanobody targeting complement receptor Vsig4 and its cross reactivity. Immunobiology, 2016 . （SCI IF：3.4）
(5) Zheng F, Put S, Bouwens L, Lahoutte T, Matthys P, Muyldermans S, De Baetselier P, Devoogdt N, Raes G, Schoonooghe S*. Molecular imaging with macrophage CRIg-targeting Nanobodies for early and preclinical diagnosis in a mouse model of rheumatoid arthritis. Journal of Nuclear Medicine. 2014 May;55(5):824-9. （SCI IF：10.5，影像学领域排名前三期刊）
(4) Zheng F, Devoogdt N, Amanda Sparkes, Chlotthys P, Muyldermans S, De Baetselier P, Devoogdt N, Schoonooghe S, Raes G*. Monitoring resident liver macrophages using Nanobodies targeting Vsig4 : Concanavalin A induced acute hepatitis as paradigm. Immunobiology, 2015 Feb;220(2):200-9. （SCI IF：3.4）
(3)郑芳; 罗思羽; 韩燕; 宁启兰; 温玉荣*，靶向巨噬细胞膜蛋白Vsig4特异性纳米抗体的构建和筛选，西安交通大学学报(医学版), 2017.1, 38(1): 7~12，核心期刊
(2)郑芳; 罗思羽; 韩燕; 宁启兰; 温玉荣*，靶向巨噬细胞膜蛋白Vsig4特异性纳米抗体的构建和筛选，西安交通大学学报(医学版), 2017.1, 38(1): 7~12，核心期刊
(1) Fang ZHENG; Yurong WEN(*)，The Necessity of Experimental Animal Training Program in Chinese Institution and University， 2016 International Conference on Education, Science and Education Management (ESEM 2016).
受邀会议
20. 基础医学类专业工作委员会第一次会议，2025年，天津
19.The 15th Anniversary of Protein and Peptide conference, 2024年，日本，奈良
18.Chemorevelution, 化学革命 国际会议，2024年，中国，三亚
17.“十校”青年学者教学与科研交流会，2024年，长沙
16.第 三 届 全 国 电 子 信 息 材 料 与 器 件 大 会暨 “ 电 子 信 息 与 未 来 ”科 学 家 论 坛，2024,年 中国，杭州
15.2 0 2 4 生 物 材 料 与 生 物 医 学 工 程 学 术 会 议，2024年,成都
14.Optorevelution, 光学革命 国际会议，2023年，中国，三亚
13. Canadian society for immunology(CSI),加拿大免疫学会 2019年年会 ，班夫，加拿大，April 12 – 15
12. Radiological Society of North American （RSNA）2017，芝加哥，美国
11. World Molecular Imaging Congress (WMIC) 2017, 费城，美国
10. The 5th Hsien Wu and Ray Wu Symposia，2017，西安，中国
9. International Congress of Immunology 2016，墨尔本，澳大利亚
8. 全国生物化学与分子生物学年会 2016，中国，杭州
7. World Molecular Imaging Congress (WMIC) 2014, 首尔. 韩国
6. BIT's 4th Annual World Gene Convention-2013 (WGC) conference, 2013, 海口, 中国
5. Annual Conference of the European Macrophage and Dendritic Cell Society (EMDS), 2013, Erlangen, 德国
4. VIB seminar, 2013, Blankenberge, Belgium.
3. The Belgium Immunology Socity meeting (BIS), 2013, Liege, Belgium
2. World Molecular Imaging Congress (WMIC) 2012, Dublin, Ireland
1. 5th ESF/Affinomics Workshop: Affinity Proteomics, 2011, Alpbach, Austria